18.09.13 г. ФГБУ «Краснодарская МВЛ» получена лицензия на осуществление деятельности в области использования возбудителей инфекционных заболеваний человека и животных и генно-инженерно-модифицированных организмов ΙΙΙ и ΙV степени потенциальной опасности, осуществляемых в замкнутых системах. Регистрационный номер 77.99.18.001.Л.000157.10.08, от 28.08.2013г, выдана Федеральной службой по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека. Срок действия - бессрочно.
Данная лицензия дает право учреждению на проведение диагностических исследований материала, зараженного или с подозрением на зараженность микроорганизмами 2-4 групп патогенности, гельминтами 3-4 групп патогенности, хранение музейных штаммов микроорганизмов.